Bakterie- och svamp-DNA, sekvensering
Klinisk mikrobiologi
| Alternativa sökord: |
|
| Indikationer / kompletterande analyser: |
Kontakta laboratoriet vid frågor, telefon 08-517 719 99.
Misstanke om bakterieorsakad infektion inklusive Tropheryma whipplei Beställ: Bakterie-DNA, sekvensering (16S) -Csv, -vävnad -övrigt. Vid övrigt provmaterial, ange typ av prov på Lokalisation. Prov kan tas vid negativ odling eller från normalt sterila provlokaler. Riklig förekomst av normalflora stör analysen. Misstanke om invassiv/djup svampinfektion Beställ: DNA svamp, sekvensering -övrigt, ange typ av prov på Lokalisation. |
| Remiss: |
Klinisk mikrobiologi
|
| Provtagning: |
Bakterie-DNA, sekvensering (16S)
Ta företrädesvis prov från normalt sterila provlokaler. Blod analyseras inte. Undantagsvis kan material från icke sterila lokaler även analyseras. Kontakta laboratoriet vid frågor. Sterilt provrör/burk, utan tillsats - cerebrospinalvätska,0,5 mL - vävnad, biopsin läggs i röret utan tillsats - övrigt, ta provmaterial från normalt sterila provlokaler DNA svamp, sekvensering Sterilt provrör/burk - bronkoalveolärt lavage (BAL), 2-3 mL Provtagning BAL - cerebrospinalvätska, 2 mL Provtagning Csv - punktat, 3-5 mL - vävnad, sätt till fysiologisk koksaltlösning så det täcker biopsin. blod, EDTA lila propp |
| Förvaring / transport: |
Förvara provet kylt.
Skicka provet enligt lokala ordinarie rutiner. Provet bör nå laboratoriet inom 48 timmar. Om längre transporttid frys provet vid -20◦C. |
| Svarsrutiner: |
Bakterie-DNA, sekvensering (16S), DNA svamp, sekvensering: Svar lämnas inom 1 vecka. Undantaget är vid storhelger då flera röda dagar sammanfaller.
|
| Ackreditering: |
För information om vilka analyser och provmaterial som omfattas, se utdrag från Ackrediteringens omfattning. Förteckningen finns på laboratoriets kliniksida.
|
| Kommentar: |
DNA svamp, sekvensering: ITS-regionen (Internal Transcribed Spacer) sekvenseras istället för 18S, som var den tidigare målregionen.
|