Helgenomsekvensering av coronavirus startad på Karolinska Universitetssjukhuset
Behovet av att öka övervakningen av coronavirusets varianter via helgenomsekvensering är stort. Karolinska Universitetssjukhuset har snabbt etablerat diagnostiken inom ramen för ett etablerat samarbete med genomik och precisionsmedicin, SciLifeLab.
Liksom alla regioner har Region Stockholm i uppdrag från Folkhälsomyndigheten att analysera 10 procent av de positiva covid- 19 prover som kommer in i länet. I Stockholm är det Karolinska Universitetslaboratoriet som samordnar analyserna.
En helgenomsekvensering innebär att det görs en analys av hela arvsmassan av det virus som förekommer i provet, totalt 30 000 baser, vilket visar vilken variant av viruset det handlar om.
Under vecka 6 har de första drygt 100 provsvaren levererats till Folkhälsomyndigheten och Smittskydd Stockholm. Det rör prover som togs på sjukhus och vårdcentraler i Stockholm under de sista två veckorna i januari 2021.
- Analys av mer än dubbelt så många prov från februari pågår just nu, och vi siktar mot att landa på minst 500 prover per vecka. Karolinska Universitetslaboratoriets kapacitet för att ta emot prover från Stockholm och andra regioner ökar snabbt, säger Claes Ruth, funktionschef Karolinska Universitetslaboratoriet.
Analyserade proven
Bland de analyserade proven tillhör en majoritet (61 procent) den spanska variant som dominerat smittspridningen i Sverige och Europa under hösten 2020. Hos den spanska varianten, och merparten av de övriga varianterna av viruset som detekterades i dessa första 100 provsvar, fanns inga oroande egenskaper. Två prov tillhörde den brittiska varianten, men eftersom urvalet inte är helt slumpmässigt speglar detta inte nödvändigtvis förekomsten av den brittiska varianten i regionen under andra halvan av januari. Inget prov har hittills varit av den sydafrikanska eller brasilianska varianten.
Senaste nyheterna
-
Sektion hud med sexuell hälsa har invigt sina nya lokaler på Ersta sjukhus
Karolinska Universitetssjukhusets Sektion hud med sexuell hälsa har sedan 2022 funnits på Södersjukhuset. Nu har verksamheten och dess 60 medarbetare flyttat till Ersta sjukhus.
-
Precisionsmedicin implementeras i cancervården på Karolinska
På Karolinska Universitetssjukhuset är precisionsmedicin ett användbart verktyg inom cancerdiagnostiken. – Genom mer omfattande genomikanalyser på cancerceller kan man få en bättre ...