I Huddinge finns två slutenvårdsenheter, I52/I54 på plan 5 och I62/I64 på plan 6.
På varje avdelning finns isoleringsmöjligheter, det vill säga möjlighet att vårda patienter med smittsamma och/eller komplicerade infektioner, i enskilda rum.Slutenvårdsenheten på plan 5 har specialutbildad personal för vård av patienter med infektioner och beroendeproblem. Här har också beretts särskilda platser för patienter med MRSA samt inrättats en studentenhet där patienter kan vårdas mellan måndag och fredag.
På plan 6 finns särskilt förberedda rum, redo att ta emot patienter med högriskinfektioner. Dessa patienter har företräde, övriga kan vid platsbrist flyttas till någon av de övriga infektionsavdelningarna.