I december 2011 antog sjukhusledningen ett nytt Miljö- och Hållbarhetsprogram. Programmet är utarbetat för en period på fem år och bygger på att Karolinska Universitetssjukhuset ska genomföra förbättringar inom de områden där verksamhetens miljöpåverkan är som störst.
Fokus riktas mot två miljömålsområden - Hälsofrämjande miljöarbete samt Resurs-och Klimateffektivt - för vilka sjukhusövergripande miljömål har fastställts.

Miljömål: Läkemedel
- Vi ska minska användningen av utvalda miljöfarliga läkemedel till år 2016.
- Vi ska minska risken för uppkomst och spridning av antibiotikaresistens i miljön genom att optimera användningen av antibiotika till 2016.
- Vi ska uppnå 15 procents minskning av avfall i kategorin cytostatika och läkemedelsförorenat avfall till år 2016.
Miljömål: Kemiska ämnen
- Vi ska minska användningen av giftiga ämnen och CMR-ämnen med 70 procent till 2016.
- Mängden PVC och ftalater i inköpta varor ska minska med 25 procent till 2016.
Miljömål: Materialresurser
- Vi ska minska användningen av utvalda engångsprodukter med 20 procent till 2016.
- Vi ska öka källsorteringsgraden till 30 procent.
Miljömål: Utsläpp av klimatpåverkande gaser
- Utsläppen av klimatpåverkande gaser ska minska med 30 procent till år 2016.
Miljömål: Energi
- Vi ska minska vår energianvändning för uppvärmning, kylning och el med 10 procent till år 2016.