En stor del av transplantationsimmunologiska laboratoriets analyser utgörs av HLA-typningar. HLA eller vävnadstypning görs både inför organ- och stamcellstransplantation samt som led i utredningen av vissa HLA-associerade sjukdomar. Omfattningen av HLA-typningarna beror på vilken typ av utredning som görs. Eftersom patienter och donatorer bör vara HLA- lika på allelnivå vid stamcellstranplantation kräver dessa transplantationer en mer djupgående vävnadstypning än vid organtransplantation. Vid diagnostiska typningar görs vanligtvis typningar av några få specifika HLA-locus beroende på vilken sjukdom som utreds. För utförliga uppgifter om HLA-systemets uppbyggnad och nomenklatur se The Anthony Nolan Trust.Principen för den vävnadstypningsteknik som används mest på laboratoriet är PCR-SSP (polymerase chain reaction -sequence-specific primers). På laboratoriet används också PCR-SSO (polymerase chain reaction-sequence-specific oligonucleotides) samt sekvensbaserad typning.