Vid Klinisk immunologi utförs laboratoriediagnostik och rådgivning inom områdena allergi, autoimmunitet, immunbrist och inflammation. Vidare utförs immunologisk utredning vid organ- och stamcells- transplantationer och terapeutisk cellhantering. Verksamheten omfattar även en immunbristmottagning som utreder och behandlar patienter med immunbrist.