Sjukhistoria och vanlig kroppslig undersökning är grunden för diagnos.
I tillägg används blodprover och lumbalpunktion för att påvisa infektion. Lumbalpunktion innebär provtagning av ryggmärgsvätskan genom ett stick med tunn nål mellan två ländryggskotor. I ryggmärgsvätskan analyseras tecken på inflammation samt förekomst av bakterie eller virus.Electroencephalogram (EEG) visar oftast tecken på störd hjärnfunktion. Ibland kan röntgen av hjärnan med datortomografi eller magmetröntgen bli aktuell, till exempel för att i svårbedömda fall särskilja annan orsak till symptomen, såsom hjärnblödning eller tumör.